Goście muzeum będą zaczynać zwiedzanie od najwyższej kondygnacji, a następnie stopniowo schodzić w dół, poznając coraz ciemniejsze karty historii.

Wystawa stała składać się będzie z 9 galerii. Opowie o okresie od lat 70. XIX w. (gdy otwarto budynek, który dziś jest siedzibą muzeum) do 1946 r. (gdy stał się on siedzibą Centralnego Komitetu Żydów w Polsce).

Na wystawie zaprezentowane zostaną autentyczne eksponaty z epoki, w tym m.im. jeden z zaledwie kilku istniejących egzemplarzy niemieckiego Raportu Stroopa, opisującego eksterminację getta.

Jednym z eksponatów muzeum będzie zrekonstruowany przez Tramwaje Warszawskie tramwaj z 1907 r., który w trakcie wojny kursował przez getto.

Wartość inwestycji to ponad 295 mln zł.